研究経過
【プレスリリース】DNAの1塩基の違いをハイスループットに判別できる新技術「PRIMA」を開発(清水グループ:瀬々班)
November 16, 2021 4:16 PM
Category:研究成果
main:瀬々班
当領域瀬々班の横浜市立大学木原生物学研究所 角井宏行 特任助教(研究当時、現 新潟大学 特任助教)、清水健太郎 客員教授(チューリッヒ大学教授兼任)、チューリッヒ大学 山﨑美紗子 博士の研究グループは、DNAの1塩基の違いを電気泳動法により効率的に判別できる新しい手法PRIMA(プリマ, Probe-induced Heteroduplex Mobility Assay)を開発しました(図1)。
本手法は、5塩基欠失をもつ40塩基の一本鎖DNAをプローブとして用いることで、従来の電気泳動法では見分けることが難しかったDNAの1塩基というわずかな違いを迅速・簡便・安価に判別できます。1塩基挿入/欠失個体を効率的に判別できるだけでなく、一塩基多型(SNP)を判別できる事例も示し、現在盛んに行われているゲノム編集研究やゲノムDNA研究、遺伝子多型解析をさらに加速させることができると期待されます。
また、今回の研究成果について、学会賞も受賞しました!
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第140回講演会日本育種学会優秀発表賞
講演番号313
DNAの1塩基差を迅速・簡便に判別できるPRIMA (Probe-induced heteroduplex mobility assay)法の開発
☆角井 宏行1,2, 山﨑 美紗子1, 清水 健太郎1,2 (1チューリヒ大・進化生物環境研, 2横浜市大・木原生研)
https://www.nacos.com/jsb/07/07prize_2021.html
プレスリリース詳細はこちら
https://www.yokohama-cu.ac.jp/news/2021/20211022kakui.html
<発表論文>
タイトル: PRIMA: a rapid and cost-effective genotyping method to detect single-nucleotide differences using probe-induced heteroduplexes
著者: Hiroyuki Kakui, Misako Yamazaki, Kentaro K. Shimizu
掲載雑誌: Scientific Reports
DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-021-99641-x