植物は芽生えが起きた場所で生育する。当たり前といえば当たり前。ただ、逆に考えると、その芽生えが起きた場所の環境に適応しているということ。同一作目の同一品種を栽培しても、寒冷地と西南暖地では生育、開花、結実、果実の食味などが異なる。試験場などでは長年に亘り、こうした植物側の生育data、気温などの環境変動のdataを取っている。そのdataとゲノムdataを突合できたら。。。そんな話を聞いたとき、確かに先達の苦労が忍ばれるというのではなく、宝物になるのがすぐに理解できた。
そんな解析をやってみようと誘って頂き、福島大学食農学類附属発酵醸造研究所の菅波博士、東北大・農、名古屋大・生物機能、福井県大・生物資源、明治大・農の方々との共同研究により、Plant Physiol.の3月号に論文が掲載(Suganami et al. (2023) Effective use of legacy data for GWAS to improve the credibility of QTL detection in rice. Plant Physiol. 191: 1561-1573.)されました。pdfはfree downloadですので、是非、ご覧下さい。2022年は著書を発表することができましたが、原著論文はなく、2021年の9月以来です。引き続き、よい形でのコラボができればと。
わたなべしるす
PS. 福島大でプレス発表された資料のpdfがあります。あわせて参考にして下さい。
【研究成果】先達の大量調査dataをGWAS解析に活かす「Plant Physiol.」(4/13)
2023年4月13日 (木)
【お知らせ】日本植物生理学会・みんなのひろば・植物Q&A・質問コーナー「じゃがいもの芽の色について」への回答(4/10)
2023年4月10日 (月)
今週も仙台の気温は高め。ガラス室で咲いているアブラナの花は種によっては満開。ちょっと困ったなと思うこの頃。一方で、週末には寒気が入り、東北、北陸地方では雪、みぞれ、霰など。農作物への被害が出なければよいのですが。。。
そうした中、昨年は2回の回答する機会を頂いた「日本植物生理学会・みんなのひろば・植物Q&A」。今年最初は、「じゃがいもの芽の色について」。ジャガイモの育種が進み、地下茎であるイモの横断面は黄色、紫色など多様に。そんなことを知ってはいても、実際に作付けすることがないので。こんな時に助けてもらったのが、大学時代の同期で普段から現場を見ている方。とても貴重な議論の時間でした。寒暖の差が激しい今年の特徴なのだろうと。
わたなべしるす
【お知らせ】2023年入試説明会・研究室公開; 4/22(土), オンライン面談; 5/7(日)への参加登録可能に(3/22)
2023年3月22日 (水)
3月になってから4-5月のような気温と日射、その逆の冬に逆戻りのような冬と初夏のような天候の繰り返し。とはいえ、暖かい日にちの方が多いこともあり、今月中にソメイヨシノが開花するのではという予報。そんな暖かさが運んでくれたのか、日本がWBCを14年ぶりに制覇。
1月半ばにこのHPからお知らせしましたとおり、2023年入試説明会・研究室公開、オンライン面談を4月、5月に実施することをお知らしました。ようやく、広報のHPができあがり、参加登録が可能になりました。申し込みのHPは、
https://www.lifesci.tohoku.ac.jp/admission/2023/
です。詳細は上記のURLからアクセスして頂ければと思いますが、対面でのイベントを2019年以来で行うことから、これまでとは異なるポスターを研究科で作成しました。
渡辺の研究室で是非という方、興味を持った方、これまでzoomなどで参加しておもしろかったのでという方、学部の1, 2, 3年生の方々も、もちろん。お待ちしております。2019年に実施の時までは、研究室の説明に加えて、院生・スタッフさんと議論を行い、さらには、復活の「ケーキ会」も行いたいと思います。もちろん、大学のBCPレベルにあわせて。多くの方々に興味を持って頂き、参加いただくことを楽しみにしております。
わたなべしるす
【感謝状】仙台市教育委員会より、令和4年度「仙台市理科特別授業」への感謝状(2/15)
2023年2月16日 (木)
10oCを超えるような先週末。一方で昼になっても雪が降りながら氷点下の2月15日。冷たい風も相まって体感温度は意外と寒い。この時期は植物の管理が難しく、頭を抱えます。明日の朝も結構寒そうなので対策を講じないと。
そんな水曜日の午前中、仙台教育委員会から令和4年度「仙台市理科特別授業」への感謝状贈呈式へ。特別授業は今年度で8年連続。同じ専攻の田中先生とご一緒できたのは望外の喜びでした。。今年度はコロナ禍があったからか、仙台市立桜丘小学校に2回の出前講義でしたが、受講した皆さんからはよかったといっていただき、来年度もコラボ頂けると言うことで、コロナ禍が終息することを祈るばかりです。
わたなべしるす
PS. 2/17(金), 17:00、研究科のHPに記事が掲載されました。あわせてご覧下さい。
【記事掲載】みらい型「科学者の卵養成講座」取材記事掲載(1/24)
2023年1月24日 (火)
明日の朝は、-6oCの予報。最高気温も-3oCとか。。。そんな火曜日。2021年度からスタートしたみらい型「科学者の卵養成講座」。2022年には「三菱みらい育成財団賞」。その関係もあり、みらい型「科学者の卵養成講座」取材記事がwebに掲載。開講日にあわせて、工学部・安藤教授、農学部・伊藤准教授らと取材。どのようなコンセプトで講座を行っているかなども詳細に紹介。来年度ももちろん、開催します。是非、多くの方が応募ください。
わたなべしるす
