東北大学大学院生命科学研究科 植物分子育種分野 渡辺研究室

News Release

2015年1月の記事です。

【研究成果】植物オミックスdatabase、PODC(Plant Omics Data Center)の構築・公開をPlant Cell Physiol.に発表(国内9研究室との共同研究; 1/23)

2015年1月23日 (金)

 これまでも遺伝子発現を中心に、大量にdataを解析する、いわゆる「オミックス」研究を生殖器官を中心に行い、いくつかのpaperも出してきまし た。こうしたものの中から、思わぬものを見つけて、解析できたこともありましたが、たとえば、遺伝子発現だけでは限界があり、mRNAの発現とsmall RNAの発現をlinkさせることができれば。。研究室的には、このような小さなことも結構大変なことで。というか、懸案でもあって。。。また、詳しいこ とは、いつの日にか。。。

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  そのイネでの発現データなどを統合して、さらにはイネ以外の植物のdataをあわせると。。今まで見逃していたものが見いだせるかも。。。ということで、 今回の論文発表では、明治大・矢野教授の研究室を中心とした、渡辺の研究室を入れると10研究室を統合した共同研究を行い、これまでにはない植物オミック スdatabase、PODC(Plant Omics Data Center)の構築・公開をPlant Cell Physiol.のdatabase特集号に掲載と なりました。database特集は冊子体には、綴じられておらず、電子版のみでの公開です(Ohyanagi et al. (2015) Plant omics data center: an integrated web repository for interspecies gene expression networks with NLP-based curation. Plant Cell Physiol. 56: e9., http://pcp.oxfordjournals.org/content/56/1/e9.abstract?etoc)。なお、本論文はOpen accessとなっていますので、是非、目を通していただき、Plant Omics Data Center(http://bioinf.mind.meiji.ac.jp/podc/)をご活用頂ければ、幸いです。

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 わたなべしるす

 

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