文部科学省科学研究費補助金「新学術領域研究」
6月10日から14日まで、当新学術領域の計画研究班である寺内博士が企画した「MutMap
workshop」に、新潟大学から4名参加しました。
MutMap法は寺内班が近年目覚ましい発展を遂げている次世代シーケンサーを有効に活用した迅速な遺伝子同定技術として発表されたものです。本講習会では、最初の3日間、MutMapを扱う際に必要となるR、Perl、Shellの講習を受け、最後の2日間で実際にMutMapの扱いについて教えていただきました。
本技術は、岩手県でも注目されているようで、岩手日報や岩手日日等からの取材がありました (私の写真が岩手日日に掲載されました)。また、岩手県では、MutMapを利用した品種育成まで期待されているようです。本講習会には、全国各地から20名を超える研究者が集まりました。皆さん、MutMapをはじめ、次世代シークエンサーを活用して自身の研究を進展させたいと考えているようで、MutMap法は多くの人に注目されている技術であると感じました。
講師陣は、講義が円滑に進むようたくさんの時間を割いて、資料を作成していただいたようです。また、運営陣も、我々が快適に過ごせるようにたくさんの準備をしていただき、さらに、我々研究者がたくさん交流できる機会を企画していただきました。ありがとうございました。
私自身、RNA-seq、ChIP-seq等、次世代シークエンサーを用いて研究を進めていますが、大量のシークエンスデータをどのように活用すれば、より多くの情報を得られるかという点で苦労しています。今回の講習を契機に、大量データを円滑に扱う勉強を進めていきたいと考えています。
新潟大 藤本 龍
MutMap Workshopに参加した学生の感想を下に載せておきます。
年々、次世代シークエンサーにかかるコストは安くなっていることから、これからの研究において次世代シーケンサーの重要性がますます増してくると考えられます。しかし、一方で大量なデータを活用する技術が必要となってきます。そこで、次世代シークエンサーから得られる大量のデータの取り扱いについて勉強したいと思い、MutMap講習に参加しました。
講習会においては、高木講師を始め夏目講師、八重樫講師が、「Wet」と「Dry」の間に架け橋を作るべく、全くプログラムというものに触れたことのない私達に対して丁寧に分かりやすく熱心に講義をして頂きました。完全にマスターすることは無理でしたが、多くの点で意識が変わり「Dry」な世界に挑戦したいという気持ちになっています。今回の講習会を受けたことにより自身の持つ研究の幅を広げる機会となりました。