文部科学省科学研究費補助金「新学術領域研究」
これまでにDNAマーカーを用いた連鎖解析により,イネいもち病に対する抵抗性遺伝子座が同定されてきました。しかし、従来の連鎖解析を用いたQTL同定方法では、交配に用いた両品種間で多型を示すDNAマーカーを作成するステップにおいて多くの労力および時間を必要としました。今回、論文に掲載されたQTL-seq法は、次世代シーケンサーを用いることで、DNAマーカーを作成することなく迅速にQTL同定を可能にする技術です。
本方法を用いることで、従来のDNAマーカーを用いた連鎖解析によるQTL同定法と比較して、迅速かつ低コストでQTLを同定することが可能になりました。
QTL-seq: Rapid mapping of quantitative trait loci in rice by whole genome resequencing of DNA from two bulked populations
Hiroki Takagi, Akira Abe, Kentaro Yoshida, Shunichi Kosugi, Satoshi Natsume, Chikako Mitsuoka, Aiko Uemura, Hiroe Utsushi, Muluneh Tamiru, Shohei Takuno, Hideki Innan, Liliana M. Cano, Sophien Kamoun and Ryohei Terauchi
The Plant Journal, 2013, DOI: 10.1111/tpj.12105
論文紹介 (寺内@岩手生工研)